Cả hai mẫu xe tiếp tục sử dụng nền tảng đã được cập nhật từ năm 2020, với động cơ được cải tiến rõ rệt – bao gồm đầu xi-lanh mới và hệ thống phun nhiên liệu được điều chỉnh lại vị trí, đáp ứng tiêu chuẩn khí thải Euro 5, đồng thời có khả năng hoạt động ở vòng tua cao hơn. Tuy nhiên, phiên bản YZF-R1M được trang bị thêm các linh kiện làm từ titanium, giúp động cơ ổn định và chịu nhiệt tốt hơn so với bản tiêu chuẩn.
Yamaha YZF-R1 và YZF-R1M 2025 sử dụng động cơ 4 xy lanh thẳng hàng loại DOHC, tổng dung tích 997cc, làm mát bằng dung dịch. Đặc biệt, động cơ này dùng trục khuỷu kiểu crossplane, giúp các xy-lanh không đốt cháy đồng thời như động cơ 4 xi-lanh truyền thống, mang lại cảm giác tăng tốc khác biệt. Cả hai phiên bản đều cho công suất cực đại 200 mã lực tại 13.000 vòng/phút và mô-men xoắn cực đại 113 Nm tại 11.500 vòng/phút.
Phiên bản 2025 được cải thiện khả năng vào cua và hiệu suất khí động học. Phía trước có cánh gió (spoiler) lớn hơn, yên xe cũng được thiết kế lại giúp người lái thay đổi tư thế dễ dàng hơn và bám xe tốt hơn. Hệ thống treo trước sử dụng phuộc KYB với công nghệ SDF (Separate Damping force Function), giúp điều chỉnh lực giảm xóc chính xác. Hệ thống phanh trước trang bị kẹp phanh Brembo Stylema và kẹp phanh dạng radial, tăng hiệu quả phanh.
Phiên bản R1M được nâng cấp đáng kể với hệ thống treo điện tử Öhlins ERS (Electronic Racing Suspension), cùng với hệ thống điều khiển trung tâm YRC (Yamaha Ride Control), cho phép tùy chỉnh chi tiết các hệ thống điện tử: Hệ thống kiểm soát độ bám đường (TCS), (SCS) Hệ thống kiểm soát trượt, Hệ thống hỗ trợ khởi động nhanh (LCS), Hệ thống sang số nhanh (QSS), Hệ thống kiểm soát bốc đầu, Quản lý phanh động cơ, Kiểm soát phanh, Hệ thống giảm xóc điện tử.
Yamaha YZF-R1 bản tiêu chuẩn có hai màu: Deep Purplish Blue Metallic C và Matte Dark Gray Metallic và có giá bán là 2.530.000 yên – khoảng 463 triệu đồng khi quy đổi ra tiền Việt. Trong khi đó, Yamaha YZF-R1M có màu đặc biệt Black Metallic X, cùng với logo đặc biệt và số thứ tự sản xuất riêng biệt trên bình xăng, giá bán phiên bản này là 3.289.000 yên – khoảng 602 triệu đồng.
